IC – LSB – IC MONTELIBRETTI

 

 DESCRIZIONE DELLE ATTIVITA’ DI RICERCA E RIFERIMENTI DELLA PERSONA DI CONTATTO

@Gallipoli with Prof. Toshimasa Itoh from Showa University of Tokyo

La nostra attività di ricerca si rivolge principalmente allo studio dei recettori nucleari PPAR (Peroxisome Proliferator-Activated Receptors) che esercitano un ruolo chiave in patologie quali il diabete di tipo 2 e più in generale nella regolazione del metabolismo glucidico e lipidico, nella mediazione della risposta genica durante l’adipogenesi e anche in fenomeni legati all’infiammazione.

Il nostro gruppo ha contribuito ampiamente alla ricerca in questo settore ed ha evidenziato nuove caratteristiche strutturali dei PPAR in complesso con ligandi che interagiscono con differenti regioni del LBD (Ligand Binding Domain). I cambiamenti conformazionali indotti dai ligandi conferiscono una risposta biologica differenziata in modelli cellulari ed animali, dimostrando così una stretta relazione struttura/attività in base al profilo di agonismo del ligando. Il nostro interesse è rivolto a molecole sintetiche o naturali (es. resveratrolo, acido betulinico e saponine) in qualità di più efficaci e sicuri candidati per il trattamento del diabete di tipo 2 e dei disordini metabolici.

@Lecce with Prof. Keiko Yamamoto and Prof. Toshimasa Itoh from Showa University of Tokyo

Recentemente, attraverso un approccio multidisciplinare che include principalmente la cristallografia a raggi X, ma anche NMR, SAXS, HDX e mutagenesi sito diretta, abbiamo studiato i cambiament conformazionali di PPARγ indotti dall’interazione con Cdk5, nel tentativo di approfondire meglio le basi molecolari del meccanismo di inibizione della fosforilazione di PPARγ.

 

Referente : GIORGIO POCHETTI

e-mail:  giorgio.pochettiATic.cnr.it

Tel : +39 0690672633

 
 
 PERSONALE COINVOLTO : 

@ ESRF Grenoble

Davide’s Bachelor Degree

 

 

 

 

 

 

 

GIORGIO POCHETTI

ROBERTA MONTANARI

DAVIDE CAPELLI

 

 

 

 FACILITIES E LABORATORI A DISPOSIZIONE : 

Laboratorio di Biologia Strutturale

Accesso alla Crystallization facility Robot Matrix E-drop presso Università La Sapienza  (Dipartimento di Biochimica) e alle diffraction beam-line facilities presso il Sincrotrone  Elettra (Trieste) e ESRF (Grenoble).

 
 
 PROGETTI DI RICERCA NEL GRUPPO: 

  • ACRAF 3 e ACRAF 4 “Crystallographic studies on the complexes of OXA-48 Beta Lactamase with new inhibitors”.
  • Instruct Integrated Biology PID:1579 “Structural explanation of CDK5-mediated PPARg phosphorylation and its allosteric inhibition by PPARg small molecule modulators”.
  • AIRC 2018 “A Structure-guided approach to target the Aurora-A/N-Myc complex in MYCN-amplified Neuroblastoma”.

 
 
 PUBBLICAZIONI NEL GRUPPO : 

  • Gloria Brusotti*, Roberta Montanari* , Davide Capelli , Giulia Cattaneo , Antonio Laghezza, Paolo Tortorella , Fulvio Loiodice, Franck Peiretti, Bernadette Bonardo, Alessandro Paiardini, EnricaCalleri (*equal contribution), “Betulinic acid is a PPARγ antagonist that hampers adipogenesis and promotes osteogenesis”, Scientific Reports 7(1), 5777 (2017).
  • D.Capelli, C. Cerchia, R. Montanari, F. Loiodice, P. Tortorella, A., Laghezza, L. Cervoni, G. Pochetti and A. Lavecchia, “Structural basis for PPAR partial or full activation revealed by a novel ligand binding mode” Scientific Reports 6: 34792 (2016).
  • Roberta Montanari, Davide Capelli, Aldo Tava, Andrea Galli, Antonio Laghezza, Paolo Tortorella, Fulvio Loiodice & Giorgio Pochetti, “Screening of saponins and sapogenins from Medicago species as potential PPARγ agonists and X-ray structure of the complex PPARγ/caulophyllogenin” Scientific Reports 6: 27658 (2016).
  • Lori, A. Pasquo, R. Montanari, D. Capelli, V. Consalvi, R. Chiaraluce, L. Cervoni, F. Loiodice, A. Laghezza, M. Aschi and G. Pochetti“Structural Basis of the Transactivation Deficiency of Human PPARg F360L Mutant Associated with Familial Partial Lipodystrophy” Acta Cryst D 70 1965-76 (2014).
  • Montanari, R., Saccoccia, F., Scotti, E., Crestani, M., Godio, C., Gilardi, F., loiodice F. , Fracchiolla G., Laghezza A., Tortorella P., Lavecchia A., Novellino E., Mazza F., Aschi M.,  Pochetti, G. Crystal structure of the peroxisome proliferator-activated receptor gamma (ppargamma) ligand binding domain complexed with a novel partial agonist: a new region of the hydrophobic pocket could be exploited for drug design. Journal of Medicinal Chemistry, 51(24), 7768-7776 (2008).

 
 

Mentana, Rome, Dec 2010

Jesse Pinkman and Heisenberg @IC-SBL

In Japan