Istituto di Cristallografia - CNR
Ricercatore

Caporale Andrea

Trieste

ISTRUZIONE E FORMAZIONE

  • Giugno 2016: Abilitazione all’esercizio della Professione di Farmacista
  • 2008-2016: Laurea magistrale in Farmacia conseguita presso l’Università degli studi di Napoli “Federico II”, 17 Marzo 2016 (voto: 104/110)
  • 2003-2008: Dottorato di ricerca in Scienze Molecolari, indirizzo Chimico, conseguito presso l’Università degli Studi di Padova, Dipartimento di Scienze Chimiche, 10 Aprile 2008.
  • 2000-2001: Diploma di Specializzazione in Sintesi Chimica, Università degli Studi di Milano, Dipartimento di Chimica Organica ed Industriale, 15 Marzo 2002.
  • Novembre 1999: Abilitazione all’esercizio della Professione di Chimico
  • 1993-1999: Laurea in Chimica, vecchio ordinamento, conseguita presso l’Università degli studi di Padova, Dipartimento di Chimica Organica, 14 Ottobre 1999 (voto: 106/110).

ESPERIENZA LAVORATIVA

  1. Dal 30 Settembre 2019 ad oggi: Ricercatore a tempo determinato del CNR (matr. 18778), presso l’Istituto di Cristallografia sede secondaria di Basovizza (TS). Collabora con il gruppo di peptidi antimicrobici del prof. Alessandro Tossi, presso il Dipartimento di scienze della Vita dell’Università degli studi di Trieste.
  2. Dal 04/07/2019 al 05/07/2020: Visiting researcher presso il gruppo di Chemical Biology della prof.ssa Marina Rubini, UCD, Dublin.
  3. Dal 21/11/2016 al 20/11/2018
  4. Assegnista presso il IBB-CNR di Napoli sotto la supervisione del dr Menotti Ruvo
  5. Dal 01/10/2012 al 31/10/2016: Assegnista presso CIRPeB Univ. di Napoli “Federico II” sotto la supervisione del dr Menotti Ruvo
  6. Dal 01/09/2010 al 31/08/2012: Assegnista del Dipartimento di Scienze Molecolari e Nanosistemi dell’Università Ca’ Foscari Venezia sotto la supervisione del Prof. Ottorino De Lucchi (assegno in collaborazione con l’azienda F.I.S. di Vicenza)
  7. Dal 01/09/2009 al 31/08/2010: Postdoc presso Fachgebiet fuer Peptidbiochemie, TUM, sotto la supervisione della prof.ssa Aphrodite Kapurniotu
  8. Dal 30/05/2008 al 01/07/2009: Borsista presso il Dipartimento di Scienze Chimiche dell’Università di Padova sotto la supervisione del Prof. Evaristo Peggion
  9. Dal 01/01/2004 al 31/12/2007: Dottorato in Scienze Molecolari presso Dipartimento di Chimica Organica dell’Università di Padova sotto la supervisione del Prof. Evaristo Peggion
  10. Dal 01/10/2007 al 30/04/2008: Visinting young reseaercher presso University of Regensburg, Germany sotto la supervisione della prof.ssa Chiara Cabrele
  11. Dal 01/05/2003 al 31/12/2004:Assegnista presso Dipartimento di Chimica Organica dell’Università di Padova sotto la supervisione del Prof. Evaristo Peggion
  12. Dal 03/10/2001 al 30/04/2003
  13. Ricercatore a tempo determinato presso l’Istituto di Ricerche Chimiche e Biochimiche “G. Ronzoni” sotto la supervisione del Dott.ssa Alma Dal Pozzo
  14. Dal 04/04/2001 al 20/10/2001
  15. Borsista presso CNR – Centro di Studio sulla Sintesi e Stereochimica di speciali sistemi Organici – Università di Milano sotto la supervisione del Prof. Carlo Scolastico
  16. Dal 01/01/2000 al 30/09/2001: Borsista presso Dipartimento di Chimica Organica e Industriale dell’Università di Milano sotto la supervisione del Prof. Carlo Scolastico

Il dr Andrea Caporale è co-autore di oltre 50 lavori scientifici pubblicati su riviste internazionali (h-index:18 – www.scopus.com) e di alcuni brevetti farmaceutici (5) internazionali non decaduti in collaborazioni con aziende nazionali leader di API farmaceutici, come la Fabbrica Italiana Sintetici, F.I.S., Alte di Montecchio (VI). Negli ultimi 5 anni è stato co-autore di 28 lavori di cui 7 come primo autore o corresponding author.

La sua attività di ricerca si concentra sulla sintesi, in particolar modo quella peptidica e peptidomimetica. Nel corso del suo percorso formativo ha approfondito alcune tematiche della sintesi organica fine per la preparazione di molecole otticamente attive e si scaffold per la sintesi di peptidomimetici (sotto la supervisione del Prof. Carlo Scolastico all’università di Milano Statale, sotto la supervisione del Prof. Ottorino De Lucchi all’università Ca’ Foscari a Venezia). Si è interessato alla sintesi in fase solida ed alle modifiche che si possono apportare direttamente in resina prima a Milano e successivamente a Regensburg sotto la direzione della dr Chiara Cabrele.

A Napoli, il dr Caporale si è occupato della progettazione, purificazione via HPLC e caratterizzazione dei peptidi preparati all’interno delle attività di ricerca del gruppo del dr Menotti Ruvo: dalla produzione di anticorpi, alla sintesi di peptidi modello per studi SAR, di peptidi come elementi di funzionalizzazione di composti biologicamente attivi usati come markers diagnostici. Il 30% delle attività copriva la sintesi di frammenti peptidici dei fattori di crescita, PlGf e VEGF coinvolti nel sistema di interazione delle proteine Nodal/Alk4/Crypto, responsabili di processi tumorali. In questo contesto, l’attività di ricerca si concentrava sull’identificazione dei residui responsabili del riconoscimento e del binding con lo scopo di costruire alcuni mimetici in grado di inibire l’interazione tra le proteine. Parallelamente, si è interessato alla sintesi e alla caratterizzazione di frammenti peptidici, di library di analoghi della sequenza 370-394 di AIF, per comprendere le caratteristiche strutturali dei meccanismi con cui si instaurano i processi neuronali apoptotici facenti capo alla proteina CypA. Le analisi strutturali impiegano l’uso delle tecniche di Dicroismo Circolare e di Fluorescenza.

Si è inoltre, interessato all’individuazione ed allo studio di nuove sequenze non native dell’enzima M-TGase per la funzionalizzazione di proteine con scopi farmaceutici, introducendo in modo sito-specifico e in condizioni blande nuove funzioni sia chimiche che biologiche via legami isopeptidici. Nello specifico, questa tecnica viene impiegata per la funzionalizzazione di proteine sia a scopo diagnostico che terapeutico.

Nel periodo speso a Dublino (UCD) il dr Caporale si è interessato della sintesi enantioselettiva della 4-MethylProline ed ha appreso alcune competenze per l’espressione di proteine e proteine modificate con AA non naturali al fine di avere mutazioni sitospecifiche delle sequenze amminoacidiche.

Attualmente il dr Caporale, presso l’Università degli Studi di Trieste, si occupa della progettazione, della sintesi e della caratterizzazione di peptidi antimicrobici ricchi in prolina in collaborazione con i proff A. Tossi e M. Scocchi.  Collabora, inoltre con il prof. F. Berti alla sintesi di peptidi modello conformazionalmente costretti come substrati per sintesi organiche e ligandi di sostanze naturali.

  • Collaborazioni con altri Istituti CNR: IBB-CNR, Napoli
  • Collaborazioni con Università Italiane: Università degli studi di Trieste (Dipartimenti di Scienze della Vita e Dipartimento di scienze Farmaceutiche e Chimiche; Università degli studi di Napoli, Federico II (dipartimento di Farmacia); Università degli Studi di Salerno (dipartimento di Farmacia); Politecnico di Torino, dipartimento di Ingegneria Meccanica e Aerospaziale).
  • Collaborazioni Internazionali: University College Dublin, School of Chemistry.
Oxidized Substrates of APEH as a Tool to Study the Endoprotease Activity of the Enzyme

Sandomenico, Annamaria; Gogliettino, Marta; Iaccarino, Emanuela; Fusco, Carmela; Caporale, Andrea; Ruvo, Menotti; Palmieri, Gianna; Cocca, Ennio

International journal of molecular sciences (Online) (2022)

Peptide-Protein Interactions: From Drug Design to Supramolecular Biomaterials

Andrea Caporale (1),Simone Adorinni (2),Doriano Lamba (1,3), and Michele Saviano(4)

Molecules (Basel, Online) (2021) [IF=4.927]

Natural and synthetic halogenated amino acids–structural and bioactive features in antimicrobial peptides and peptidomimetics

Mardirossian, Mario; Rubini, Marina; Adamo, Mauro F.A.; Scocchi, Marco; Saviano, Michele; Tossi, Alessandro; Gennaro, Renato; Caporale, Andrea

Molecules (Basel, Online) (2021) [IF=4.927]