Biologia strutturale delle neurotrofine e proneurotrofine
Caratterizzazione strutturale e funzionale di neurotrofine, proneurotrofine e loro mutanti patologici. Studi strutturali del ruolo delle biomolecole endogene come modulatori delle neurotrofine e delle proneurotrofine.
Studi bioinformatici sull’evoluzione delle proneurotrofine umane in quanto proteine intrinsecamente disordinate.
Clonaggio, mutagenesi, espressione ricombinante delle proneurotrofine umane in corpi di inclusione; refolding e purificazione mediante sistemi cromatografici. Produzione di neurotrofine mature mediate digestione triptica e purificazione.
Caratterizzazione biofisica e strutturale dell’effetto sulla conformazione delle neurotrofine e proneurotrofine umane di mutazioni patologiche mediante dinamica molecolare, limited proteolysis, DSF, Fluorescenza e SAXS. Analisi della loro interazione con ligandi di rilevanza fisiologica e patologica, mediante SAXS, DSF, fluorescenza, GCI ed ITC.
– Covaceuszach S, Peche LY, Konarev PV, Lamba D. A combined evolutionary and structural approach to disclose the primary structural determinants essential for proneurotrophins biological functions. Comput Struct Biotechnol J. (2021) May 7;19:2891-2904.
– Paoletti F, Merzel F, Cassetta A, Ogris I, Covaceuszach S, Grdadolnik J, Lamba D, Golič Grdadolnik S. Endogenous modulators of neurotrophin signaling: Landscape of the transient ATP-NGF interactions. Comput Struct Biotechnol J. (2021) May 7;19:2938-2949
– Paoletti F., de Chiara C., Kelly G., Covaceuszach S., Malerba F., Yan R., Lamba D., Cattaneo A., Pastore A. Conformational Rigidity within Plasticity Promotes Differential Target Recognition of Nerve Growth Factor. Front Mol Biosci. (2016) 3:83
– Covaceuszach S., Konarev P. V., Paoletti F., Krastanova I., Svergun D.I., Lamba D., Cattaneo A. “The conundrum of the high-affinity NGF binding site formation unveiled?”. Biophysical J. (2015) 108(3):687
