Istituto di Cristallografia - CNR
Tecnologo

Alberga Domenico

Bari

Domenico Alberga ha conseguito il Dottorato in Fisica presso l’Università degli Studi di Bari nel 2016 con la tesi “Molecular Simulation Techniques Applied to the Study of Polymeric and Biological Systems”. Nel 2016 è stato ricercatore post-dottorato presso l’Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris – Parigi (Francia). Dal 2017 al 2018 è stato ricercatore post-dottorato presso l’Università di Bari (Dipartimento di Farmacia – Scienze del Farmaco). Dal 2018 al 2020 ha lavorato nell’unità HPC del CINECA a Bologna. Dal 2021 al 2022 ha lavorato come software developer in Exprivia s.p.a a Molfetta (BA). Da giugno 2023 è tecnologo del Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR) Istituto di Cristallografia sede di Bari. Ha una grande esperienza in simulazioni di Dinamica Molecolare e metodi predittivi di machine learning applicati alla cheminformatica. È autore di più di 40 articoli su riviste internazionali peer-reviewed.

– Simulazioni di Dinamica Molecolare di sistemi biologici e materiali.
– Metodi di Density Functional Theory.
– Analisi ed elaborazione di dati cheminformatici multidimensionali.
– Algoritmi predittivi di machine learning e deep learning.
– Gestione Cluster di calcolo HPC
– Python, Fortran, C/C++, Java, Hibernate, Spring, Weblogic, PostgreSQL, MongoDB, Geoserver, GIS, WS REST, Java Microservices, Business Services WSO2

Abilitazione scientifca nazionale per professore universitario di II fascia nel settore 02/D1 FISICA APPLICATA, DIDATTICA E STORIA DELLA FISICA (06/11/2024)
Nel 2024 ha conseguito l’abilitazione scientifica nazionale alle funzioni di professore universitario di II fascia del settore 02/D1 FISICA APPLICATA, DIDATTICA E STORIA DELLA FISICA.
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Molecular interactions between a diphenyl scaffold and PED/PEA15: Implications for type II diabetes therapeutics targeting PED/PEA15 – Phospholipase D1 interaction

Mercurio, Ivan, D’Abrosca, Gianluca, Della Valle, Maria, Malgieri, Gaetano, Fattorusso, Roberto, Isernia, Carla, Russo, Luigi, Di Gaetano, Sonia, Pedone, Emilia Maria, Pirone, Luciano, Del Gatto, Annarita, Zaccaro, Laura, Alberga, Domenico, Saviano, Michele, Mangiatordi, Giuseppe Felice

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL (2024)

SIGMAP: an explainable artificial intelligence tool for SIGMA-1 receptor affinity prediction

Lomuscio, Maria Cristina, Corriero, Nicola, Nanna, Vittoria, Piccinno, Antonio, Saviano, Michele, Lanzilotti, Rosa, Abate, Carmen, Alberga, Domenico, Mangiatordi, Giuseppe Felice

RSC MEDICINAL CHEMISTRY (2024)

DeLA-DrugSelf: Empowering Multi-Objective De Novo Design through SELFIES Molecular Representation

Domenico Alberga, Giuseppe Lamanna, Giovanni Graziano, Pietro Delre, Maria Cristina Lomuscio, Nicola Corriero, Alessia Ligresti, Dritan Siliqi, Michele Saviano, Marialessandra Contino, Angela Stefanachi, Giuseppe Felice Mangiatordi

COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE (2024)

ALPACA: A machine Learning Platform for Affinity and selectivity profiling of CAnnabinoids receptors modulators

Delre, Pietro; Contino, Marialessandra; Alberga, Domenico; Saviano, Michele; Corriero, Nicola; Mangiatordi, Giuseppe Felice

Computers in biology and medicine (2023) [IF=7.700]

Erratum: Catmos: Collaborative acute toxicity modeling suite

Mansouri, Kamel; Karmaus, Agnes; Fitzpatrick, Jeremy; Patlewicz, Grace; Pradeep, Prachi; Alberga, Domenico; Alepee, Nathalie; Allen, Timothy E.H.; Allen, Dave; Alves, Vinicius M.; Andrade, Carolina H.; Auernhammer, Tyler R.; Ballabio, Davide; Bell, Shannon; Benfenati, Emilio; Bhattacharya, Sudin; Bastos, Joyce V.; Boyd, Stephen; Brown, J. B.; Capuzzi, Stephen J.; Chushak, Yaroslav; Ciallella, Heather; Clark, Alex M.; Consonni, Viviana; Daga, Pankaj R.; Ekins, Sean; Farag, Sherif; Fedorov, Maxim; Fourches, Denis; Gadaleta, Domenico; Gao, Feng; Gearhart, Jeffery M.; Goh, Garett; Goodman, Jonathan M.; Grisoni, Francesca; Grulke, Christopher M.; Hartung, Thomas; Hirn, Matthew; Karpov, Pavel; Korotcov, Alexandru; Lavado, Giovanna J.; Lawless, Michael; Li, Xinhao; Luechtefeld, Thomas; Lunghini, Filippo; Mangiatordi, Giuseppe F.; Marcou, Gilles; Marsh, Dan; Martin, Todd; Mauri, Andrea; Muratov, Eugene N.; Myatt, Glenn J.; Nguyen, Dac Trung; Nicolotti, Orazio; Note, Reine; Pande, Paritosh; Parks, Amanda K.; Peryea, Tyler; Polash, Ahsan; Rallo, Robert; Roncaglioni, Alessandra; Rowlands, Craig; Ruiz, Patricia; Russo, Daniel; Sayed, Ahmed; Sayre, Risa; Sheils, Timothy; Siegel, Charles; Silva, Arthur C.; Simeonov, Anton; Sosnin, Sergey; Southall, Noel; Strickland, Judy; Tang, Yun; Teppen, Brian; Tetko, Igor V.; Thomas, Dennis; Tkachenko, Valery; Todeschini, Roberto; Toma, Cosimo; Tripodi, Ignacio; Trisciuzzi, Daniela; Tropsha, Alexander; Varnek, Alexandre; Vukovic, Kristijan; Wang, Zhongyu; Wang, Liguo; Waters, Katrina M.; Wedlake, Andrew J.; Wijeyesakere, Sanjeeva J.; Wilson, Dan; Xiao, Zijun; Yang, Hongbin; Zahoranszky-Kohalmi, Gergely; Zakharov, Alexey V.; Zhang, Fagen F.; Zhang, Zhen; Zhao, Tongan; Zhu, Hao; Zorn, Kimberley M.

Environmental health perspectives (2021) [IF=11.035]

CATMoS: Collaborative acute toxicity modeling suite

Mansouri, Kamel; Karmaus, Agnes L.; Fitzpatrick, Jeremy; Patlewicz, Grace; Pradeep, Prachi; Alberga, Domenico; Alepee, Nathalie; Allen, Timothy E.H.; Allen, Dave; Alves, Vinicius M.; Andrade, Carolina H.; Auernhammer, Tyler R.; Ballabio, Davide; Bell, Shannon; Benfenati, Emilio; Bhattacharya, Sudin; Bastos, Joyce V.; Boyd, Stephen; Brown, J. B.; Capuzzi, Stephen J.; Chushak, Yaroslav; Ciallella, Heather; Clark, Alex M.; Consonni, Viviana; Daga, Pankaj R.; Ekins, Sean; Farag, Sherif; Fedorov, Maxim; Fourches, Denis; Gadaleta, Domenico; Gao, Feng; Gearhart, Jeffery M.; Goh, Garett; Goodman, Jonathan M.; Grisoni, Francesca; Grulke, Christopher M.; Hartung, Thomas; Hirn, Matthew; Karpov, Pavel; Korotcov, Alexandru; Lavado, Giovanna J.; Lawless, Michael; Li, Xinhao; Luechtefeld, Thomas; Lunghini, Filippo; Mangiatordi, Giuseppe F.; Marcou, Gilles; Marsh, Dan; Martin, Todd; Mauri, Andrea; Muratov, Eugene N.; Myatt, Glenn J.; Nguyen, Dac Trung; Nicolotti, Orazio; Note, Reine; Pande, Paritosh; Parks, Amanda K.; Peryea, Tyler; Polash, Ahsan H.; Rallo, Robert; Roncaglioni, Alessandra; Rowlands, Craig; Ruiz, Patricia; Russo, Daniel P.; Sayed, Ahmed; Sayre, Risa; Sheils, Timothy; Siegel, Charles; Silva, Arthur C.; Simeonov, Anton; Sosnin, Sergey; Southall, Noel; Strickland, Judy; Tang, Yun; Teppen, Brian; Tetko, Igor V.; Thomas, Dennis; Tkachenko, Valery; Todeschini, Roberto; Toma, Cosimo; Tripodi, Ignacio; Trisciuzzi, Daniela; Tropsha, Alexander; Varnek, Alexandre; Vukovic, Kristijan; Wang, Zhongyu; Wang, Liguo; Waters, Katrina M.; Wedlake, Andrew J.; Wijeyesakere, Sanjeeva J.; Wilson, Dan; Xiao, Zijun; Yang, Hongbin; Zahoranszky-Kohalmi, Gergely; Zakharov, Alexey V.; Zhang, Fagen F.; Zhang, Zhen; Zhao, Tongan; Zhu, Hao; Zorn, Kimberley M.

Environmental health perspectives (2021) [IF=11.035]