Istituto di Cristallografia - CNR

Approccio multidisciplinare per lo studio delle proteine ​​coinvolte nel meccanismo molecolare di una malattia rara come la Sindrome di Shwachman Diamond

La sindrome di Shwachman- Diamond è una malattia rara che dal punto di vista molecolare, appartiene ad una classe di malattie note come ribosomopatie. Le due proteine maggiormente coinvolte sono la SBDS e EFL1

La sindrome di Shwachman- Diamond (SDS), una rara malattia, descritta per la prima volta nel 1964, associa difetti ematologici con una sindrome dismorfica, caratterizzata da lipomatosi del pancreas, causando un’insufficienza pancreatica. La SDS, dal punto di vista del meccanismo molecolare, anche se non ancora completamento chiarito, appartiene ad una classe di malattie note come ribosomopatie, legate all’alterazione della struttura del ribosoma e/o con la sua biogenesi. Le due proteine maggiormente coinvolte sono la SBDS e EFL1. L’approccio strutturale usate/da usare sono quelli della biologia strutturale: cristallografia, SAXS, cryo-EM, bioinformatica, e le simulazioni dinamica molecolare. Inoltre, stiamo esplorando la possibilità di trovare piccole molecole organiche in grado di modulare la conformazione di EFL1, sia nel caso della mancanza del contributo della proteina SBDS, per via delle sue varie mutazioni, sia delle mutazioni stesse della proteina EFL1.

Lavori di riferimento

– Delre, P., Alberga, D., Gijsbers, A., Sánchez-Puig, N., Nicolotti, O., Saviano, M., Siliqi, D., Mangiatordi, G.F. Exploring the role of elongation Factor-Like 1 (EFL1) in Shwachman-Diamond syndrome through molecular dynamics(2020) Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 38 (17), pp. 5219-5229. DOI: 10.1080/07391102.2019.1704883
– Gijsbers, A., Montagut, D.C., Méndez-Godoy, A., Altamura, D., Saviano, M., Siliqi, D., Sánchez-Puig, N. Interaction of the GTPase elongation factor like-1 with the shwachman-diamond syndrome protein and its missense mutations(2018) International Journal of Molecular Sciences, 19 (12), art. no. 4012. DOI: 10.3390/ijms19124012
– Siliqi, D., Foadi, J., Mazzorana, M., Altamura, D., Méndez-Godoy, A., Sánchez-Puig, N. Conformational flexibility of proteins involved in ribosome biogenesis: Investigations via small angle x-ray scattering (SAXS) 2018) Crystals, 8 (3), art. no. 109. DOI: 10.3390/cryst8030109
– Stepensky, P., Chacón-Flores, M., Kim, K.H., Abuzaitoun, O., Bautista-Santos, A., Simanovsky, N., Siliqi, D., Altamura, D., Méndez-Godoy, A., Gijsbers, A., Eddin, A.N., Dor, T., Charrow, J., Sánchez-Puig, N., Elpeleg, O. Mutations in EFL1, an SBDS partner, are associated with infantile pancytopenia, exocrine pancreatic insufficiency and skeletal anomalies in a Shwachman-Diamond like syndrome(2017) Journal of Medical Genetics, 54 (8), pp. 558-566. DOI: 10.1136/jmedgenet-2016-104366

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