Istituto di Cristallografia - CNR
Primo Ricercatore

Siliqi Dritan

Bari

Dritan Siliqi obtained his M.Sc degree in chemical engineering at Tirana University (Albania) and Chemistry at Bari University (Italy).  After he obtained a PhD  (Troisieme Cycle) in crystal chemistry of solids at Université Paris VI, Paris, France. He was (1985-1992)  an associated professor/researcher at Tirana University (Department of Chemistry, Faculty of Natural Sciences) and currently, he is a senior scientist at the Institute of Crystallography and head of  2Cryst-Lab. During his scientific career, he was visiting professor and scientist in international groups such as Membrane Protein Laboratory (MPL). c/o Diamond Light Source Ltd. (Didcot, Regno Unito), Protein Crystallography Station c/o Los Alamos National Laboratory (Los Alamos, USA), Beamline cSAX12 c / o Paul Scherrer Institute Villigen, Svizzera, EMBL c/o DESY Hamburg, Germania, Institut für Physik der kondensierten Materie. Lehrstuhl für Kristallographie und Strukturphysik (Erlangen, Germania), ISIS – Neutron and Muon Source Science and Technology Facilities Council Rutherford Appleton Laboratory (Didcot, Regno Unito), The Maastricht Multimodal Molecular Imaging Institute (M4I), Division of Nanoscopy, Maastricht University (Paesi Bassi).

Author of more than 120 articles published in International Journals; WOS h-index:23 Google scholar h-index 26

The study by crystallography and Small-Angle-X-ray-Scattering of proteins, and their complex, involved in different diseases.

Structural/morphological characterization of nanostructured (bio-) materials, in particular by means of small and wide-angle x-ray scattering (SAXS and WAXS),

Developing and Improving the algorithms for data analysis: SUNBIM, Siliqi et. al. J. Appl. Cryst.(2016). 49, 1107–1114 6]

Department of Physics, Institute for Fundamental Physics and Applications, University of Trento, Italy

Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico.

Laboratorio de Estudios Cristalográficos, Instituto Andaluz de Ciencias de la Tierra, C.S.I.C. University of Granada, Spain

Maastricht Multimodal Molecular Imaging Institute, Maastricht University, Netherlands

Liver Disease Laboratory, Center for Cooperative Research in Biosciences (CIC bioGUNE), Bizkaia, Spain

Instituto deQu ́ımica F ́ısica“Rocasolano,”Consejo Superior de Investigaciones Cient ́ıficas (CSIC),Madrid,Spain

Institute of Biostructures and Bioimaging (IBB) – CNR, Naples, Italy.

Dipartimento di Scienze della Terra e Geoambientali, Università di Bari

FIMIF, University Polytechnic of Tirana, Albania

Ivodent Accademy, Tirana, Albania

Malattie genetiche: la speranza di cura in un enzima (08/09/2017)
Per alcune malattie genetiche come fibrosi cistica o morbo di Gaucher, la speranza potrebbe arrivare dalla regolazione dell’enzima che controlla alcune proteine alterate in queste malattie. A sostenerlo uno studio a cui hanno partecipato l’Istituto di scienze delle produzioni alimentari (Ispa) unità di Lecce e l’Istituto di cristallografia sede di Bari (Ic) del Consiglio nazionale delle ricerche. Il lavoro, pubblicato sulla rivista Proceedings of the National Academy of Sciences (Pnas), è stato coordinato da Nicole Zitzmann e Pietro Roversi del Dipartimento di biochimica dell’Università di Oxford. “Circa il 20% delle proteine presenti nelle cellule eucariotiche (caratteristiche degli organismi multicellulari) sono glicoproteine, essenziali per molti processi vitali come la risposta immunitaria, la comunicazione cellulare e il metabolismo”, spiega Angelo Santino, ricercatore Ispa-Cnr. “La funzionalità delle glicoproteine dipende da un sofisticato sistema biologico di ‘controllo qualità’ che sovrintende al corretto ripiegamento e alla corretta destinazione finale delle proteine stesse nella cellula. Con questo studio abbiamo descritto per la prima volta la struttura completa di uno dei principali componenti di questo sistema di controllo, l’enzima Udp-glucosio glucosil transferasi (Uggt). Conoscendo la struttura dell’enzima sarà possibile individuare in futuro nuove molecole in grado di modularne l’attività”. Questa scoperta comporta l’apertura di nuovi scenari terapeutici per il trattamento di alcune malattie. “La modulazione di enzimi come Uggt potrebbe rappresentare un’opportunità di cura per molte patologie genetiche caratterizzate da mutazioni associate al malripiegamento di glicoproteine, come la fibrosi cistica o il morbo di Gaucher”, prosegue Dritan Siliqi dell’Ic-Cnr. “Non è detto che ad una glicoproteina mal ripiegata sia sempre associata una completa perdita di funzionalità e la modulazione degli enzimi del sistema di controllo potrebbe consentire alle proteine parzialmente mal ripiegate il raggiungimento della loro destinazione finale in cellula e il ripristino, almeno parziale, dell’attività biologica”. “La ricerca è stata condotta su piante di Arabidopsis thaliana, un modello di riferimento per lo studio di processi biologici conservati anche nell’uomo”, conclude Lucia Marti dell’Ispa-Cnr. “Nel nostro laboratorio sono disponibili piante di Arabidopsis mutate che non possiedono l’enzima Uggt. Queste piante costituiscono un utile modello per saggiare l’effetto di nuove molecole a potenziale azione farmacologica prima della sperimentazione su modelli animali ben più costosi e con limitazioni etiche”.
Link
The crystal structure of the EspB-EspK virulence factor-chaperone complex suggests an additional type VII secretion mechanism in Mycobacterium tuberculosis

Gijsbers, A. and Eymery, M. and Gao, Y. and Menart, I. and Vinciauskaite, V. and Siliqi, D. and Peters, P.J. and McCarthy, A. and Ravelli, R.B.G.

The Journal of biological chemistry (Print) (2023) [IF=5.486]

A conformational rearrangement of the SARS-CoV-2 host protein sigma-1 is required for antiviral activity: insights from a combined in-silico/in-vitro approach

Abatematteo, Francesca Serena; Delre, Pietro; Mercurio, Ivan; Rezelj, Veronica V.; Siliqi, Dritan; Beaucourt, Stephanie; Lattanzi, Gianluca; Colabufo, Nicola Antonio; Leopoldo, Marcello; Saviano, Michele; Vignuzzi, Marco; Mangiatordi, Giuseppe Felice; Abate, Carmen

Scientific reports (Nature Publishing Group) (2023) [IF=4.997]

Influence of Intramineral Proteins on the Growth of Carbonate Crystals Using as a Scaffold Membranes of Ratite Birds and Crocodiles Eggshells

Elejalde-Cadena, Nerith R.;Hernandez, Denisse; Capitelli, Francesco; Islas, Selene R.; Rosales-Hoz, Maria J.; Zema, Michele; Tarantino, Serena C.; Siliqi, Dritan* and Moreno, Abel*

Membranes (Basel) (2023) [IF=4.200]

Structural Characterization of Low-Sr-Doped Hydroxyapatite Obtained by Solid-State Synthesis

Francesco Baldassarre, Angela Altomare, Ernesto Mesto, Maria Lacalamita, Bujar Dida, Altin Mele, Elvira Maria Bauer, Massimo Puzone, Emanuela Tempesta, Davide Capelli, Dritan Siliqi, Francesco Capitelli

Crystals (Basel) (2023) [IF=2.700]

A Comparative Molecular Dynamics Study of Selected Point Mutations in the Shwachman-Bodian-Diamond Syndrome Protein SBDS

Spinetti E.; Delre P.; Saviano M.; Siliqi D.; Lattanzi G.; Mangiatordi G.F.

International journal of molecular sciences (Online) (2022) [IF=6.208]

Formation of calcium phosphate nanoparticles in the presence of carboxylate molecules: a time-resolved in situ synchrotron SAXS and WAXS study

Siliqi, Dritan and Adamiano, Alessio and Ladisa, Massimo and Giannini, Cinzia and Iafisco, Michele and Degli Esposti, Lorenzo

CrystEngComm (Camb., Online) (2022) [IF=3.545]

The effect of chemical structure of carboxylate molecules on hydroxyapatite nanoparticles. A structural and morphological study

Degli Esposti L.; Adamiano A.; Siliqi D.; Giannini C.; Iafisco M.

Bioactive Materials Online (2021) [IF=16.874]

X-ray Characterization of Conformational Changes of Human Apo- and Holo-Transferrin

Campos-Escamilla, Camila and Siliqi, Dritan and Gonzalez-Ramirez, Luis A. and Lopez-Sanchez, Carmen and Gavira, Jose Antonio and Moreno, Abel

International journal of molecular sciences (Online) (2021) [IF=6.208]

The structure and flexibility analysis of the Arabidopsis synaptotagmin 1 reveal the basis of its regulation at membrane contact sites

Benavente J.L.; Siliqi D.; Infantes L.; Lagartera L.; Mills A.; Gago F.; Ruiz-Lopez N.; Botella M.A.; Sanchez-Barrena M.J.; Albert A.

EMBO journal (Online) (2021) [IF=5.780]

Table-top combined scanning X-ray small angle scattering and transmission microscopies of lipid vesicles dispersed in free-standing gel

Scattarella, Francesco; Altamura, Emiliano; Albanese, Paola; Siliqi, Dritan; Ladisa, Massimo; Mavelli, Fabio; Giannini, Cinzia; Altamura, Davide

RSC advances (2021) [IF=4.036]

Structural Analysis of the Partially Disordered Protein EspK from Mycobacterium Tuberculosis

Gijsbers, Abril; Sanchez-Puig, Nuria; Gao, Ye; Peters, Peter J.; Ravelli, Raimond B. G.; Siliqi, Dritan

Crystals (Basel) (2021) [IF=2.670]